Die Realisierung des Kinderhospiz Flamingo wird durch die Stiftung Kinderhospiz Schweiz ermöglicht.
Die Stiftung Kinderhospiz Schweiz wurde 2009 von betroffenen Eltern und Unterstützern der Kinderhospizbewegung gegründet. Sie ist politisch und religiös neutral und gesamtschweizerisch tätig. Ein ehrenamtlicher, interdisziplinär zusammengesetzter Stiftungsrat führt die Stiftung Kinderhospiz Schweiz und wird dabei von Beiräten aus wichtigen Fachbereichen unterstützt.
Für die Trägerschaft wurde die Kinderhospiz Flamingo AG gegründet, eine vollständig im Besitz der Stiftung Kinderhospiz Schweiz stehende Betriebsgesellschaft. Die Organe der Betriebsgesellschaft bestehen derzeit ausschliesslich aus Vertretern des Stiftungsrates. Die Gesellschaft hat keine Gewinnorientierung, erwirtschaftete Mittel werden für das Wohl betroffener Familien eingesetzt.